Apa itu Operon?

· Nama: Eka Puspita Mirasari
· NIM: B1J006135
· Kelas: A2
· Email: kha_mani3z@yahoo.com
· Blog: http://ekha2.wordpress.com
· Jenis Topik: A2-AG8

Ringkasan

Operon adalah suatu kelompok gen struktural beserta situs pengontrol yang mengatur kecepatan transkripsi gen. Semua gen dalam satu operon dinyatakan sebagai suatu unit yang tunggal. Pengaturan jenis ini sering dijumpai dalam genom prokariot. Operon ini ada dua unsur yang mengatur transkripsi gen struktural penyandi enzim yaitu regulator (gen represor) dan operator yang letaknya berdekatan dengan gen-gen struktural yang diaturnya. Gen regulator menyandi pembentukan suatu protein yang dinamakan represor. Pada kondisi tertentu represor akan berikatan dengan operator menyebabkan terhalangnya transkripsi gen-gen struktural. Hal ini terjadi karena enzim RNA polimerase tidak dapatm memasuki promoter yang letaknya berdekatan atau bahkan tumpang tindih dengan operator. Selain itu, ada operon-operon bakterial lainnya tetapi masih belum dimengerti dengan baik dan memiliki struktur yang berbeda dengan yang dijumpai pada operon laktosa E.coli. bakteri E. coli mengandung semua informasi genetik yang dibutuhkan untuk metabolisme, tumbuh, dan bereproduksi.

Operon lac

Operon laktosa merupakan suatu sistem model yang baik untuk sejumlah konsep regulasi gen pada prokariot. Operon lac ini terdiri dari tiga gen struktural yang mengkonversi laktosa gula disakarida masuk ke dalam unit monosakarida-glukosa dan galaktosa. Monosakarida merupakan substrat dari pembangkit energi glikolisis sehingga fungsi gen-gen di dalam operon laktosa ke dalam bentuk yang dapat digunakan E.coli sebagai sumber energi. Laktosa bukan komponen dari lingkungan alami E.coli sehingga operon tidak bisa diekspresikan dan enzim-enzim untuk pemanfaatan laktosa. Ketiga gen struktural tersebut adalah : (Lac Z, Lac Y, Lac A) dan tiga situs pengontrol (Lac CRP, LacP1, dan Lac U). Gen-gen struktural Lac Z, Lac Y, Lac A secara berurutan mengkode enzim β-galaktosidase, fermease, dan transasetilase. Katabolisme (pemecahan) laktosa sangat membutuhkan protein ini. Situs pengontrol merupakan suatu pengikatan RNA polimerase (suatu promotor)

Gambar 1. Operon Laktosa pada Escherichia coli. (Brown, 2002)

(A). Operon laktosa. Ketiga gen tersebut adalah lacZ, lacY dan lacA.
Dua pasangan pertama mengandung 52 bp dan yang kedua mengandung 64 bp.
Ketiga gen tersebut di ekspresikan bersama, lacY mengkode enzim laktosa
permease masuk ke dalam komponen gula-galaktosa dan glukosa.

Gambar 2. Operon lactosa dengan tiga struktur gen

sumber: http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/L/LacOperon.htm

Gambar 3. Operon Triptopan pada Escherichia coli. (Brown, 2002)

(B) Operon triptopan mengandung lima gen yang mengandung 5 gen yang
megkode enzim tahap biokimia. Gen pada operon triptopan merupakan
penutup operon laktosa: trpE and trpD overlap oleh 1 bp, trpB dan trpA;
trpD dan trpC 4 bp, dan trpC dan trpB oleh 12 bp.

The Tryptophan Operon

Operon triptopan merupakan contoh dari biosintesis operon yang diregulasi oleh efektor. Operon berisi 5 struktur gen yang mengkode 3 enzim untuk merubah asam korismik ke dalam triptopan.

Sintesis anthranilate

Komponen I – dikode oleh trpE

Komponen II – dikode oleh trpD

· N-(5′-phosphoribosyl)- isomerase anthranilate/Indole-3-glycerol sintase pospat – dikode oleh trpC

· Sintesis triptopan

B-subunit – dikode oleh trpB

a-subunit – dikode oleh trpA

Operon juga mengandung gen yang mengkode oligopeptida pendek (trpL). Ekspresi yang diregulasikan oleh protein reseptor triptopan yang mengkode oleh gen trpR. Tidak seperti operon lac, trpR tidak berdekatan
dengan operon. Struktur gen pada E.coli di lokasikan selama 28 menit, sedangkan trpR di lokasikan selama 100 menit. Repressor trpR regulasinya diekspresikan pada penambahan dua operon yang lain ke dalam operon trp. Protein triptopan tidak mampu menjepit operatornya sendiri. Repressor triptopan akan ditranskripsikan pada operon dan menghasilkan sintesis tiga enzim.

Gambar 4. struktur protein triptopan

Sumber: http://www.mun.ca/biochem/courses/3107/Topics/Trp_operon.html

Sumber Pustaka:

Brown, T. A. 2002. Genomes, Second Editions. John Wiley and Sons Inc.,New

Genome T. A. BROWN (2002)

(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes)

Diakses tanggal 23 September 2008, jam 07.20 WIB

Situs terkait:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes

http://www.mun.ca/biochem/courses/3107/Topics/Trp_operon.html

http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/L/LacOperon.html

http://www.execulink.com/~ekimmel/lac_operon.htm

http://www.dartmouth.edu/~cbbc/courses/movies/LacOperon.htm

eKha mengucapkan….

eKa

Untuk Mencintaimu

UNTUK MENCINTAIMU

Apa yang harus aku lakukan

Untuk membuat kau mencintaiku

Sgala upaya tlah kulakukan untukmu

Apa yang harus aku temukan

Untuk membuat kau menyayangiku

Inilah aku yang memilih kau untukku

Karna aku mencintaimu..

Dan hatiku hanya untukmu

Tak akan menyerah

Dan tak akan berhenti

mencintaimu….

Ku berjuang dalam hidupku

Untuk slalu memilikimu

Seumur hidupku, setulus hatiku,

hanya untukmu…

Pengaruh Asam Amino terhadap Kepadatan Echerichia coli dalam Merespon Nutrisi

Sekilas tentang Escherichia coli

Escherichia coli, atau biasa disingkat E. coli, adalah salah satu jenis spesies utama bakteri gram negatif. Pada umumnya, bakteri yang ditemukan oleh Theodor Escherich ini hidup pada tinja, dan dapat menyebabkan masalah kesehatan pada manusia, seperti diare, muntaber dan masalah pencernaan lainnya. E. coli banyak digunakan dalam teknologi rekayasa genetika. Biasa digunakan sebagai vektor untuk menyisipkan gen-gen tertentu yang diinginkan untuk dikembangkan. E. coli dipilih karena pertumbuhannya sangat cepat dan mudah dalam penanganannya. Bakteri dalam kelompok ini sering mengakibatkan banyak infeksi pada saluran pencernaan makanan (enterik) manusia dan hewan, juga penyebab penyakit beberapa tanaman. Laju pertumbuhan bakteri pada tanah sering tidak teratur , karena banyak bakteri hidup pada kondisi-kondisi kelaparan dan hanya bakteri yang mendiami substrat tertentu, seperti saluran pencernaan, usus, rhizospora atau lokasi di sekitar bekas akar tanaman sebagai jalan masuk mendapatkan nutrisi.

Keterkaitan asam amino terhadap sintesis pada galaktosidase menunjukkan adanya karbon atau sumber nitrogen lain.

Fluktuasi kondisi nutrisi lewat perubahan control nutrisi untuk E.coli yang ditunjukkan dengan aktivitas atau menonaktifkan perbedaan sistem molekuler yang mengkoordinasi regulasi pada metabolisme karbon, nitrogen, dan asam amino seperti pada putaran AMP (cAMP). Kumpulan asam amino membuktikan kebutuhan dan induksinya. Kesembuhan sel dari pemisahan nutrisi dan mempercepat ekspresi enzim pada substansi dengan hasil kepadatan bakteri yang tinggi. Seperti yang terlihat pada hubungan asam amino dan aktivitas enzim dan mendapatkan kondisi hiperbolik tanpa menghiraukan penambahan kondisi nutrisi yang lain. Kemudian dengan membandingkan enzim galaktosidase dan pertumbuhan pada kondisi asam adalah cukup untuk mempengaruhi E.coli untuk mempertahankan hidup bahkan dengan mengorbankan sejumlah besar dari kerugian individu. Sehingga dapat diketahui konsekwensi b-galaktosidase dan laju pertumbuhan E.coli

Nama : Eka Puspita Mirasari
NIM : B1J006135
Email : kha_mani3z@yahoo.com
Blog : http://ekha2.wordpress.com
Referensi :

Bodini, S, Nunziangeli, L, and Santori, F. 2007. Iflunence of Amino Acids on Low-Density Escherichia coli Responses to Nutrient Downshifts_
Department of Environmental Biotechnologies, ISRIM Scarl, Localita` Pentima Bassa, 21, 05100 Terni, Italy. Journal of Bacteriology, Apr. 2007, p. 3099–3105 0021-9193/07/$08.00_0
Vol. 189, No. 8

menatap masa depan

Menatap Masa Depan

Tugas MikRoDas eKa

Semua begitu indah, apabila sesuatu itu di jalani dengan keikhlasan hati..

        Ga nyangka, skrg dh kuliah… semester 4 lg. Pdhl kemarin2 baru TK, SD, SMP, SMA. trz skrg kuliahhhh…. ga sia2 dah ngelewatin perjalanan panjang, akhirnya dah mpe pd taraf yg menyenangkan. 2 tahun yg lalu ja, msh ikut2 bimbel untuk ngadepin UAN, sampe ikut 2 t4 bimbel (Primagama n Nurul Fikri) biar luluz SPMB nasional…. Otak tu kaya di peres… (kelapa x di peres). Sampe yg bingung mo Kuliah dimana. di UI takut ga luluz.. akhirnya memutuskan untuk milih UNTIRTA (serang) ma di UNSOED (Pwt). Tp salah naro univ, Unsoed mlh yg pertama… Ydh dh, malah Unsoed yg keterima… Tdnya ga mo.. Tp mo di apain lg.. Usaha q selama ini haruz membuahkan hasil.. biar semua keluarga ikut seneng… Tp setalah di jalanin, ternyata banyak hikmahnya jg ko… mulai dr bayar kuliah murah, kosan murah, bisa makan enak tp murah, pokoknya dibanding di kuliah di Jakarta, Unsoed paling OK deh… khususnya my campus tercinta “BIOLOGI” yg ada cuma praktikum n laporan, tp klo ga da tu bukan biologi namanya, kaya bagai sayur tanpa garam aja, bagai kakek2 kehilangan tongkatnya, semua tu demi mo di bawa kemana masa depan qt nanti…apalagi di PWT ga kena banjir kaya di rumah… Tapi paling cape klo mudik ke hoz… butuh pengorbanan yg besar untuk bisa mpe kRumah… biz jauh banget cc… tp dengan itu semua q bisa mandiri jauh dr orang tua, menganggap semua yg ada di dunia ini pasti ada hikmahnya…
POkOknya dO d’Best aja dehhh…….

Hello world!

Welcome to WordPress.com. This is your first post. Edit or delete it and start blogging!